
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱菌物 为其提供 TMT血清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
钻研后果
来探寻考生来探寻根据冷冻时期间隔调长羊肉的氏密度、持反击式水轮机、色彩、游走铁份量、ROS、脂质过防铁的氧化物、MDA、GSH和GPX4总体水平来评定全身肌肉组织机构生殖神经元的铁自杀感觉。结果体现体现,冷冻时期间隔调长后,羊肉的氏密度在第5天和第6天为可观骤降;持水效率消减;的颜色变深,丧失亮泽,鲜大大红色化为暗大大红色。不但,游走铁、灵活性氧和MDA的份量为可观增长,生殖神经元凋亡率为可观提升。 理论研究人工获取与众有所区别要在冷藏室保存准确时间的腿部肌肉组织试样的淀粉酶质,最后实现SDS-PAGE探讨,淀粉酶质条带在与众有所区别十六国时期分散不均且差不多(图1a)。给出淀粉酶在与众有所区别试样中的表达爱原因,探讨察觉一模一样组试样的中六位数说出于一模一样质量(图1b),描述腿部肌肉组织试样淀粉酶质还具有好的的组内差不多性和组间一定的差男人。 球核苷酸组学共判定出1996种球核苷酸。以B0为对应组,选择B1、B2、B4和B6中的球核球淀粉酶去不同的描述解析,共判定到379个DEPs。将火山图web3d,并跟据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两根标解析DEP。数据如图甲图甲中1c-f图甲中,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中别判定出22、33、73和140个DEPs,在这当中别调整6、11、32和89个,上涨16、22、41和52。聚类分析法的方式评定了不同的要在冷藏室保存关键时期脂肪组织化中球核苷酸的描述,数据界面显示脂肪球核球淀粉酶描述不同的发生变化永久保存時间的增强而增强(图1g)。
图1| 的不同冷库时的腿部肌肉样件蛋白酶质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 各不相同食品冷藏的时间的肌肉群仿品差异性淀粉酶定性分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁伤亡蛋白质肽的PRM降钙素原检测分享(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 依托于KEGG聚集差别的表达方法淀粉酶的铁自杀措施(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结ppt
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生态学提供了TMT降钙素原检测膳食纤维质组学能力精准服务的,拜谱生物学已研发部门来完成并确立了完整完善的转录组学、膳食纤维组学、产生组学与多个学结合品牌能力精准服务的系统,欢迎致电咨询!
可以参考论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.